O município de Uarini foi criado pela Lei Estadual nº 96, de 19 de dezembro de 1955, sendo instalado oficialmente em 1956, com território desmembrado de Tefé. O nome tem origem indígena e está ligado ao lago Uarini, localizado na região do Médio Solimões.

O povoamento da área está associado às comunidades ribeirinhas e indígenas que viviam da pesca, da agricultura de subsistência e do extrativismo vegetal. No auge do ciclo da borracha, a localidade ganhou relevância como ponto de apoio aos seringais do entorno. Atualmente, Uarini é conhecido nacionalmente pela produção de farinha de mandioca de alta qualidade, considerada um dos símbolos gastronômicos do Amazonas.

O município está situado na Calha do Triângulo, ao lado de Japurá, Maraã, Fonte Boa, Jutaí, Alvarães, Juruá e Tefé.