O município de Novo Aripuanã foi criado pela Lei Estadual nº 1.168, de 19 de dezembro de 1961, sendo instalado oficialmente em 1963, com território desmembrado de Manicoré. O nome faz referência ao rio Aripuanã, que corta a região, com o acréscimo de “Novo” para marcar a instalação da nova sede municipal.

A história do povoamento está ligada às frentes de colonização e aos projetos de integração da Amazônia no século XX, em especial durante a expansão da exploração da madeira e da borracha. Posteriormente, com a presença de migrantes nordestinos e sulistas, consolidou-se a agricultura de subsistência, a pecuária e o extrativismo vegetal e mineral. O município tornou-se também importante no contexto das políticas federais de colonização agrícola durante as décadas de 1970 e 1980.

Novo Aripuanã está localizado na Calha do Madeira, região estratégica que reúne municípios banhados pelo rio Madeira e seus afluentes.