Manicoré está situado na Calha do Madeira, às margens do rio Madeira, e tem suas origens ligadas ao processo de colonização religiosa e militar no século XIX. O município foi criado em 4 de julho de 1877, pela Lei Provincial nº 362, desmembrado de Borba. Seu nome tem origem indígena e significa “lugar onde se amarra canoa”.

O povoamento ganhou impulso durante o ciclo da borracha, quando a extração do látex atraiu migrantes nordestinos, sobretudo cearenses. Na segunda metade do século XX, a chegada de projetos de colonização agrícola ampliou a ocupação, consolidando Manicoré como polo regional de comércio, agricultura e pecuária no sul do Amazonas.